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癌癥相關免疫組庫測序(TCRseq)
免疫組庫(Immune Repertoire sequencing(IR-SEQ))包括個體內的所有特異性不同的T淋巴細胞和B淋巴細胞克隆總和。T細胞受體(TCR)和B細胞受體(BCR)是特異性識別抗原和介導免疫應答的分子,TCR/BCR的多樣性直接反應了機體免疫應答的狀態。泛生子以多重PCR或5’RACE技術目的擴增決定B細胞受體(BCR)或T細胞受體(TCR)多樣性的互補決定區(CDR區),再結合高通量測序技術,全面評估免疫系統的多樣性,深入挖掘免疫組庫與疾病的關系。免疫組庫在疾病的早期診斷、抗體發掘、疫苗設計、認識免疫系統發育、感染性疾病治療、自身免疫系統疾病治療以及癌癥的免疫治療等領域都具有巨大的應用價值。
1. 技術路線
2.技術參數
? 樣本要求:
樣品類型:RNA樣品;
樣品總量:≥3ug RNA(提取自外周血樣本);
≥5ug RNA(提取自組織樣本);
樣品濃度:≥20 ng/ul;
? 測序策略:HiSeq PE150;
? 數據量:一般深度:12Gb clean data;
高深度:24Gb clean data;
? 項目周期:60個自然日。